1988年,朱军被特招进了兰州军区战斗歌舞团担任相声演员,为西北的官兵和人民演出了500多场次,并立三等功一次。
1991年,朱军走进了甘肃省电视台,担任甘肃省文艺演出活动主持,随后主持综艺节目《花好月圆》。1993年,主持中央电视台文艺节目《东西南北中》,随后主持中央电视台音乐栏目《中国音乐电视》。
1997年起,朱军开始主持中央电视台春节联欢晚会;同一年,其主持、编辑的音乐节目《乡风乡韵》获得金天线电视节目大赛音乐类节目第一名。1999年,在全国金话筒节目主持人评选中获银奖第一名。
2000年12月22日,朱军开始主持中央电视台谈话节目《艺术人生》。2001年,参加中央电视台元宵晚会,和尹相杰搭档表演相声《灯谜》。2002年,参加中央电视台春节联欢晚会,和曹颖、雪村合作表演小品《回家》;同一年,获得第三届“全国百家电视艺术工作者”称号。2003年,获得第21届中国电视金鹰奖最佳节目主持人奖。
2004年,朱军在中央电视台春节联欢晚会上与冯巩、周涛、李志强、刘金山合作表演小品《让一让,生活真美好》;同一年与董卿搭档主持中央电视台音乐频道开播庆典音乐会;随后主持中央电视台音乐频道的音乐家故事讲慨习述节目《音乐人生》;与周涛、施翌、张泽群主持在灿烂阳光下“心连心”艺术团“五一”赴浙江温州慰问演出。
2005年,朱军在中央电视台春节联欢晚会上与档境悼冯巩表演小品《笑谈人生》;同一年9月19日,和董卿、蓝心湄、胡倍蔚、刘中志一同主持“天涯共此时”——中央电视台中秋晚会。
2006年,朱军和冯巩、牛莉搭档在央视春晚上表演小品《跟着媳妇当保姆》;同一年与董卿、刘芳菲、张泽群共同主持中央电视台春节歌舞晚会;7月15日,主持央视三套互动类竞技性节目《想挑战吗》;7月16日,出任第三届中新歌会主持人元背夜;12月31日,和董卿搭档主持中习键慨抹央电视台诗歌朗诵节目《新年新诗会》。
2007年1月25日,朱军和董卿、康辉主持“万家灯火平安夜——公安部春节晚会”;2月份,主持“百花迎春——中国文学艺术界春节大联欢”;8月8日,和杨澜主持北京奥运会倒计时一周年庆祝活动文艺晚会;9月23日,和董卿、梁洪主持第一届亚洲青年艺术节开幕式;12月31日,主持CCTV综艺盛典,同时与张泽群、毕福剑、杨柳、任鲁豫一同表演相声《五官争功》。
2008年4月份,朱军与董卿、春妮、白岩松、杨澜主持奥运倒计时100天庆祝活动暨奥运歌曲评选活动颁奖晚会;7月29日,和董卿、张泽群、朱迅共同主持“百年圆梦——迎2008北京奥运会文艺晚会”;12月31日,和周涛搭档主持中央电视台诗歌朗诵节目《新年新诗会》。
2009年9月28日,朱军主持“《祖国万岁》——庆祝中华人民共和国成立60周年文艺晚会”;10月1日,受邀在天安门西观礼台观看国庆六十周年阅兵式,并与董卿搭档解说“首都各界庆祝中华人民共和国成立六十周年文艺晚会”。10月16日,和董卿搭档解说中华人民共和国第十一届运动会开幕式。
2010年10月31日,朱军和曹可凡、陈蓉、董卿共同主持上海世博会闭幕式文艺晚会;11月12日,和搭档董卿解说第十六届广州亚运会开幕式及亚运会序曲珠江巡游;11月27日,和搭档董卿解说第十六届广州亚运会闭幕式;12月21日,和李瑞英、康辉、董卿主持中央电视台跨年盛典。
2011年2月2日晚,朱军担任中央电视台兔年春节联欢晚会主持,和朱迅、周涛、董卿、李咏、张泽群合作;2月17日键罪凶,担任中央电视台元宵晚会主持;10月1日,和董卿主持《五星红旗我为你骄傲》——庆祝中华人民共和国成立62周年专题文艺晚会;12月31日,和董卿、周涛、张泽群共同主持《启航2012——中央电视台元旦晚会》。
2012年1月22日晚,朱军担任中央电视台龙年春节联欢晚会主持,和董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作;2月6日晚,担任中央电视台元宵晚会主持,和董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作。
2013年2月9日晚,朱军担任中央电视台蛇年春节联欢晚会主持,和董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作;6月15日,担任第三届兰州国际马拉松赛解说嘉宾,和CCTV5主持人杨建合作。
2014年1月30日,朱军和张国立、董卿、毕福剑、李思思一同主持中央电视台马年春节联欢晚会;2月14日,和董卿、毕福剑、李思思共同担任中央电视台元宵晚会主持人;10月10日,和何炅、谢娜、汪涵一同主持第十届中国金鹰电视艺术节开幕式文艺晚会。
2015年2月2日,央视春晚官方发布确认朱军担任中央电视台羊年春节联欢晚会主持,朱军和董卿、康辉、李思思、撒贝宁、毕福剑、朱迅、尼格买提合作;5月9日晚,和尼格买提联袂主持中央电视台平民选秀节目《星光大道》;12月31日,和董卿等多位主持人一同主持跨年直播节目《启航2016》。
2016年2月7日晚,朱军担任中央电视台猴年春节联欢晚会主持,和周涛、董卿、撒贝宁、李思思、尼格买提合作;2月22日晚,担任中央电视台元宵晚会主持,和周涛、董卿、撒贝宁、李思思、尼格买提合作;4月29日,和朱迅搭档主持央视综艺频道推出的音乐竞技类节目《星光大道超级版》;6月26日, 朱军通过个人微博发声,证实自己离开《星光大道》节目,由朱迅接棒;7月份,主持中央电视台综艺频道“夏季综艺周”特别节目《人生课堂》;7月18日,和董卿主持中央电视台民歌竞技类节目《中国民歌大会》。
2017年1月27日晚,朱军担任中央电视台鸡年春节联欢晚会主会场主持,和董卿、康辉、朱迅和尼格买提合作;2月11日,主持中央电视台元宵晚会,同时在晚会中与高晓攀、尤宪超表演相声《都是为你好》;4月份,参加北京卫视少儿成长音乐节目《音乐大师课》第三季,在节目中担任“老师团”成员;12月份,加盟综艺频道互动综艺节目《我要上春晚》,和张凯丽、林永健、王伟忠一同担任评委。
2018年1月5日,朱军和张蕾搭档主持《光辉时刻——哈尔滨王立平作品交响音乐会》;同一年,出任人文艺术类节目《信·中国》的主持人、制作人和总导演;1月22日,和颜丹晨主持央视综艺频道推出的春节特别节目《东西南北贺新春》;4月份,为《信中国》同名主题曲作词并参与演唱。
2020年1月5日,朱军担任湖北卫视“我和我的祖国”2020新春盛典晚会的主持人。
朱军人物评价朱军是勤奋和敬业的,在中央电视台工作的时间里,取得了许多成绩。经过多年的“打磨”,他的主持风格日渐成熟。台下的他比印象中电视荧屏上黑瘦。黑,是健康的黑;瘦,是精干的瘦。在《人生课堂》节目中,他的主持风格以及着装、语言,都与《艺术人生》不同,更加轻松活泼、接地气。(《家长》杂志、网易娱乐、人民日报海外版评)
朱军为了让自己的形象接地气,在台上自黑。在《星光大道》节目现场,他习惯性地在每个选手表演结束之后抛出一个深沉的主题。为了迎合观众让观众开心,他不仅频繁展示歌艺,还把自己不擅长的部分也展示在观众面前,逗乐了很多观众。(兰州晨报评)